Apsida spominske in birmske cerkve je ponazorjena v nekoliko pomanjšani obliki in rekonstruirana na osnovi arheoloških opazovanj ter antičnih upodobitev. Pod oltarjem se je prvotno nahajalo okostje svetnika. Izgubljene mozaike je s pomočjo starih fotografij in skic risarsko upodobil Franz Glaser.
Ker je na podlagi Janezovega razodetja duša svetega mučenika v nebesih že pred poslednjo sodbo, so si verniki želeli biti pokopani čim bližje svetniku. Tako je dobila tudi ena od donatork cerkve grob v neposredni bližini mučenikovega okostja.
Dele mozaikov iz krstne kapele so leta 1906 izrezali in jih pritrdili v beton. Večje mozaične površine, ki so ostale na licu mesta, so se pozneje izgubile. Franz Glaser pa je uspel ornamente na podlagi starih fotografij in skic risarsko rekonstruirati.
Mozaik nagrobne kapele donatork cerkve prikazuje veliko gostoto ornamentov. V bogoslužju so se vedno spominjali donatork in donatorjev ter tako ohranili njihov spomin v krščanski skupnosti.